来宾防火门胶 国生物信息中心作发布面向流感病毒的基因组语言模型

67     2026-04-21 09:04:07
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近日来宾防火门胶来宾防火门胶,国生物信息中心正式发布了面向流感病毒的基因组语言模型Influ-BERT。该模型基于Transformer架构,针对流感病毒基因组特征进行了度优化来宾防火门胶,为流感病毒亚型鉴定、致病预测等应用提供了种、智能的计解决案。

甲型流感病毒具有宿主范围广、抗原变异频繁等特点,对全球公共卫生构成持续威胁。传统的亚型鉴定法在处理低频亚型或片段缺失数据时存在局限。为此,研究团队收集并整了约90万条流感病毒基因组序列构建用语料库,以Transformer架构为核心,开发了定制化的BytePairEncoding(BPE)分词器,并针对词表大小进行门优化。通过实施域自适应预训练与任务特定微调的分阶段策略,Influ-BERT成功填补了通用基因组模型与流感特定域知识之间的语义鸿沟,实现了对流感病毒基因组的建模。

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在能评估中,Influ-BERT展现出优于传统的机器学习法和通用基因组大模型的表征学习能力,万能胶厂家实现了低频亚型自动化识别。此外,研究团队进步拓展了模型的应用边界,将其成功应用于多种呼吸道病毒(如SARS-CoV-2、鼻病毒、呼吸道胞病毒)的区分、致病预测以及基因识别等。通过引入滑动窗口扰动分析发现Influ-BERT能够自发聚焦于具有重要生物学意义的位点。这表明模型在人工标注的情况下,能够捕捉到流感病毒基因组的生物学约束。

该研究成果以“Influ-BERT:ADomain-AdaptiveGenomicLanguageModelforAdvancingInfluenzaAVirusResearch”为题,在学术期刊BriefingsinBioinformatics正式发表。国生物信息中心宋述慧研究员和巴西科学计国实验室(LNCC)AnaTerezaRibeirodeVasconcelos教授为共同通讯作者,国生物信息中心硕士研究生叶荣业与李论研究员为共同作者。研究工作获得国研发计划、“带路”科学组织联盟联研究作项、国自然科学基金面上项目、巴西里约热内卢州研究资助基金会、巴西国科学技术发展委员会的支持。

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